W ramach pakietu Slim VAT 3 zaproponowane regulacje zgodnie z którymi podatnik nie będzie wystawiał faktury zaliczkowej w przypadku, gdy całość lub część zaliczki otrzyma w tym samym okresie rozliczeniowym w którym wykona usługę lub dostarczy towar, na poczet których otrzyma zapłatę (jeśli termin wystawienia faktury jest określany na zasadach ogólnych czyli nie później niż 15-go dnia miesiąca następującego po miesiącu, w którym dokonano czynności  zgodnie z art. 106b ust. 1a ustawy o VAT).  

Nie będzie to możliwe w przypadkach o których mowa w art. 106i ust. 3-8 ustawy o VAT czyli wówczas gdy ustawodawca przewidział szczególne terminy wystawiania faktur.

Obecnie także nie jest wymagane wystawienie faktury zaliczkowej, gdy otrzymanie zaliczki i dokonanie dostawy towaru/wykonanie usługi miało miejsce w tym samym okresie rozliczeniowym. Nie wynika to jednak z przepisów, lecz z przyjętej praktyki (organy podatkowe akceptują takie dokumentowanie transakcji).

Zmiany te zostały usunięte z ustawy nowelizującej obejmującej pakiet Slim VAT 3 i ujęto je w projekcie dotyczącym KSeF (patrz: druk sejmowy nr 3242). 

W projekcie KSeF doprecyzowano ponadto, że w przypadku niewystawienia przez podatnika faktury zaliczkowej z ww. powodów (otrzymania zaliczki w tym samym okresie co wykonanie czynności, na poczet której ją otrzymano), wystawiona przez podatnika po wydaniu towaru lub wykonaniu usługi faktura będzie musiała zawierać również datę otrzymania zaliczki (jeżeli taka data będzie określona i będzie różniła się od daty wystawienia faktury).